豫湘桂戰(zhàn)役持續(xù)近8個月，國民黨軍軍隊損失兵力50-60萬(21世紀又出現(xiàn)報告文學加到70萬)，丟棄了河南、湖南、廣西、廣東、福建、貴州等省的大部或一部，使20余萬平方公里的國土淪喪敵手，6000余萬同胞處于日軍鐵蹄蹂躪之下。在這次大潰敗中，中國人民生命財產(chǎn)所受的損失是無法統(tǒng)計的。日本軍部內(nèi)部統(tǒng)計的損失(二戰(zhàn)日本體制沒有向國民公布某戰(zhàn)役整體死亡統(tǒng)計的做法)為戰(zhàn)死11742人。但是餓死病死也有至少同樣數(shù)量，這還是只計算到11月下旬的因此是不完全的(《戰(zhàn)爭與營養(yǎng)》與《餓死的英靈》記錄有病員六萬六千，而一處醫(yī)院里收容的患者六千多人死亡二午二百多，死亡率為37%)，因此至少2.4萬日軍死亡，加上傷病共十萬。。

而中國方面，河南損失88家工廠;湘桂粵3省的工廠占大后方工廠的三分之一，全部落入敵手;湖南著名的鎢、銻等重要戰(zhàn)略物資，全被日軍攫奪;豫湘桂是重要農(nóng)業(yè)地區(qū)，也被日軍掌握。日軍所到之處殘暴地燒殺搶掠，僅萍鄉(xiāng)一地，被殺害者1.9萬余人，被虜者2萬余人，婦女被侮辱者6000余人，房屋被毀700余間，農(nóng)具被毀值4700余萬元，米谷被劫5萬余擔，棉花被劫9500余擔。戰(zhàn)爭中幾十萬難民顛沛流離，每天數(shù)百人死于疾病凍餓。

豫湘桂戰(zhàn)役的大潰退是抗戰(zhàn)以來國民黨正面戰(zhàn)場的第二次大潰退，國民政府軍事委員會由于戰(zhàn)略指導失誤，戰(zhàn)役指揮失當，加之國民黨政府長期執(zhí)行避戰(zhàn)、觀戰(zhàn)政策，致使豫、湘、桂大片國土被占，空軍基地、場站被毀。使部隊大部喪失抵抗信心和戰(zhàn)斗力其軍事上的潰敗，也是其政治上腐敗的表現(xiàn)。日軍盡管達成作戰(zhàn)企圖，卻無力保障大陸交通線暢通，也未能阻擋美機空襲日本本土。由于分散了兵力，為國民黨軍隊反攻提供了條件。

重慶國民政府在日軍一號作戰(zhàn)中連番受挫失地的情形，極大程度地損害了美國對中國(尤其是以蔣介石為首的國民政府)的觀感;史迪威與蔣間在此役之前即惡化的關(guān)系更因此達到臨界點，史迪威以此役中國軍拙劣的表現(xiàn)與轄下印度藍迦滇緬遠征軍的精強做對比，直指蔣政權(quán)腐化無能是導致戰(zhàn)爭延長之主因，甚至進而主張由其取代蔣擔任中國戰(zhàn)區(qū)最高統(tǒng)帥，而蔣也幾近憤怒地要求美方撤換史迪威。

這場中美指揮權(quán)的沖突最后以美方退讓，在1944年底美國總統(tǒng)羅斯福被迫撤換史迪威告終，但美國政府及民間對中國國民黨政府的印象已轉(zhuǎn)趨不信任與輕視，一定程度上影響了戰(zhàn)后國共內(nèi)戰(zhàn)的結(jié)果 。