秦王朝在確立皇帝尊號的同時(shí)，還總結(jié)了戰(zhàn)國以來各國的官僚制度，建立起了一套適應(yīng)封建統(tǒng)一國家需要的中央政府機(jī)構(gòu)，這就是三公九卿制度。

三公即丞相、太尉、御史大夫。

九卿即奉常、廷尉、治粟內(nèi)史、典客、郎中令、少府、衛(wèi)尉、太仆、宗正。

據(jù)史料記載，三公九卿制最早用于夏朝，《禮記》：“夏后氏官百，天子有三公、九卿、二十七大夫、八十一元士?！薄霸O(shè)四輔及三公，不必備，惟其人。言使能也。”)，殷亦三公九卿，(伊尹曰：“三公調(diào)陰陽，九卿通寒暑?！?。周以太師、太傅、太保為三公(《通典·職官一》)，也有的說三公為司馬、司空、司徒(《韓詩外傳》曰：“三公之得者何？曰司馬、司空、司徒也。司馬主天，司空主土，司徒主人)，以少師、少傅、少保、冢宰、司徒、宗伯、司馬、司寇、司空為九卿。

三公的職責(zé)分別為：

丞相：最高行政長官，輔助皇帝處理政務(wù)，是皇帝的助手，同時(shí)負(fù)責(zé)對文武百官的管理，從秦開始，丞相正式成為官職，為中央政府中皇帝之下的最高長官。

太尉：最高軍政長官，協(xié)助皇帝掌管全國軍隊(duì)，負(fù)責(zé)管理全國軍事事務(wù)，但他平時(shí)沒有軍權(quán)，戰(zhàn)時(shí)也要聽從皇帝的命令，而且要有皇帝的符節(jié)才能調(diào)動軍隊(duì)，軍權(quán)實(shí)際上也是掌握在皇帝手里。

御史大夫：其地位相當(dāng)于副丞相，主要職責(zé)是管理圖籍、奏章，監(jiān)察文武百官，是皇帝的耳目。

御史大夫下設(shè)御史中丞，掌管圖書秘籍，同時(shí)監(jiān)察文武官吏;侍御史，掌管文書;監(jiān)御史，中央派到地方各郡負(fù)責(zé)監(jiān)督郡守的御史。

三公之間互不統(tǒng)屬，直接隸屬于皇帝，便于皇權(quán)集中。

三公之下還設(shè)有九卿，九卿是指古時(shí)中央政府的多個(gè)高級官員，指官位很高的人，秦漢時(shí)期的卿，不一定是九個(gè)人，九卿的職責(zé)分別為：

奉常：掌管宗廟禮儀，地位很高，屬九卿之首;

廷尉：掌管司法審判;

郎中令：掌管宮殿警衛(wèi);

衛(wèi)尉：掌管宮門警衛(wèi);

太仆：掌管宮廷御馬和國家馬政;

典客：掌管外交和民族事務(wù);

宗正：掌管皇族、宗室事務(wù);

治粟內(nèi)史：掌管租稅錢谷和財(cái)政收支;

少府：掌管專供皇室需用的山海池澤之稅及官府手工業(yè)。

秦朝時(shí)期，無論三公，還是九卿，均由皇帝任免調(diào)動，一律不得世襲。