1928年初，國民黨在中央組織部中設立專職情報的“黨務調(diào)查科”，此時，軍隊系統(tǒng)也有“參謀本部第二廳”，負責軍事諜報與電訊偵測;1931年，“中華民族復興社”(又稱“藍衣社”)的秘密核心組織“力行社”下設“特務處”，從事情報暗殺活動。1932年，黨務調(diào)查科擴充為“特工總部”，1935年改組為“黨務調(diào)查處”。

1937年4月，徐恩曾負責的“黨務調(diào)查處”與戴笠負責的“力行社”合并為“國民政府軍事委員會調(diào)查統(tǒng)計局”，由陳立夫任局長;原調(diào)查處為一處負責黨務，仍由徐恩曾任處長;原力行社為二處負責特務，仍屬戴笠管理?？梢钥闯?，初創(chuàng)階段的國民黨特務機關，組織機構變動相當頻繁。

1937年七七事變?nèi)珖箲?zhàn)，1938年初國共達成合作，隨著國共第二次合作的形成和抗日戰(zhàn)爭的不斷深入，共產(chǎn)黨在國統(tǒng)區(qū)由完全秘密轉(zhuǎn)為公開;人民的抗日愛國運動亦日益高漲，勢不可擋。1938年春，蔣介石借口抗日戰(zhàn)爭時期國難當頭，為了防止日諜漢奸活動，提高工作效率，增強抗戰(zhàn)力量，在3月29日召開的國民黨臨時全國代表大會上決定把原有的國民政府軍事委員會調(diào)查統(tǒng)計局改組，擴大成為3個公開的特務組織：

一、以第一處為基礎，建立隸屬中央黨部秘書處的國民黨中央執(zhí)行委員會調(diào)查統(tǒng)計局(簡稱中統(tǒng)或中統(tǒng)局)，局長由國民黨中央秘書長朱家驊兼任，徐恩曾任副局長，由徐負責日常實際工作。

二、第二處擴大為隸屬軍事委員會辦公廳的軍事委員會調(diào)查統(tǒng)計局(簡稱軍統(tǒng))，首任局長由陳立夫兼任，戴笠任副局長。這個局簡稱“軍統(tǒng)”。

三、隸屬軍事委員會辦公廳的特檢處(主管郵電檢查)。

1 9 3 8 年 8月，國民政府軍事委員會調(diào)查統(tǒng)計局成立，簡稱"軍統(tǒng)"它是國民黨兩個主要特務組織之一。其前身是復興社的核心組織"力行社"的特務處。軍統(tǒng)局內(nèi)勤組織共有八處、六室、一所;"軍統(tǒng)"的基本組織是"組"及直屬情報員，它們的特工人員分布到國民黨的軍隊、警察、行政機關以及交通運輸?shù)雀鱾€部門。1940年4月，蔣介石為集中對日本軍隊電訊密碼的破譯力量，下令BIS“特種技術研究應用處”(6處)加強對日情報工作。在6處中，池步洲擔任了軍政部軍用無線電總臺第43臺主任。1941年5月開始，池步洲在破譯的日本外交密電中，他已感到日本要對美國“采取斷然行動”了，并判斷： 日本對美進攻的地點可能是在珍珠港， 發(fā)動戰(zhàn)爭的時間可能選擇在星期天。 軍統(tǒng)局破譯出日本海軍將要偷襲珍珠港的密電后，通知美國海軍，但孤立主義情緒泛濫的美國當局懷疑是中國挑撥日美關系，未引起重視，以致釀成嚴重后果。

1946年8月軍事委員會改組成國防部，軍統(tǒng)局的正式名稱亦改為國防部保密局。其公開特務武裝部分與軍委會軍令部二廳合并為國防部第二廳，由鄭介民任廳長;秘密核心部分組成國防部保密局，毛人鳳為局長。解放戰(zhàn)爭期間，軍統(tǒng)主要對付共產(chǎn)黨，如在11月27日對關押在渣滓洞、白公館等地的革命志士進行了慘絕人寰的集體大屠殺，200多位革命志士倒在了勝利的黎明之前。

根據(jù)沈醉的回憶錄，戴笠曾任用張國燾組織對共產(chǎn)黨的情報工作，并在西北設置情報站，進行對我黨根據(jù)地的活動，但是由于張為高層叛變?nèi)藛T，并不清楚基層組織的運作方式，僅通過回憶錄的方式向軍統(tǒng)提供關于黨內(nèi)的高層信息，在張國燾任職期內(nèi)，滲透工作從未成功，之后張逐漸失去戴的信任，離開軍統(tǒng)。1946年戴笠乘坐飛機失事死后，軍統(tǒng)局進行改組，其公開特務武裝部分與軍委會軍令部二廳合并為國防部第二廳，由鄭介民任廳長;軍統(tǒng)局的正式名稱亦改為國防部保密局，毛人鳳為局長。專責保密防諜工作，確保國家安全。