湯若望在順治年間所受的恩寵與隆遇使得天主教當(dāng)時(shí)在中國(guó)的傳播較為順利。隨著傳教士人數(shù)的增加，活動(dòng)范圍的擴(kuò)大、信徒在不斷發(fā)展。在湯若望時(shí)代，教堂在中國(guó)已有30多處，據(jù)德禮賢先生統(tǒng)計(jì)1650年信徒人數(shù)就已達(dá)到150000人。

中西歷法之爭(zhēng)，由來(lái)已久，吳明煊早在順治十六年便上疏舉報(bào)湯若望天算錯(cuò)誤，結(jié)果反落了個(gè)“詐不以實(shí)”的罪名，險(xiǎn)些被判了死刑。1661年，順治病逝，八歲的康熙登基，輔政大臣鰲拜等反對(duì)西洋學(xué)說(shuō)，大臣楊光先，言湯若望等傳教士有罪三條：潛謀造反;邪說(shuō)惑眾;歷法荒謬。

順治皇帝的去世，使湯若望失去了宮廷保護(hù)人，他的命運(yùn)也發(fā)生了巨大的轉(zhuǎn)折。雖然關(guān)外的愛新覺(jué)羅氏家族直入北京，統(tǒng)一中國(guó)，但具有幾千年歷史的儒家思想仍然是當(dāng)時(shí)中國(guó)傳統(tǒng)文化的主流，孔孟之道根深葉茂。早在順治時(shí)期，就有一些漢族士大夫反對(duì)順治信任湯若望等傳教士，對(duì)湯若望竟然在中國(guó)發(fā)展了十幾萬(wàn)天主教徒極其不滿，極力主張從葡萄牙人手里收回澳門。安徽歙縣的官生楊光先就是他們的代表，他首先向西方傳教士發(fā)難。楊光先對(duì)天主教早有所聞，于順治十五年在京城看到被釘死于十字架上的耶穌受難畫像之后，才確認(rèn)天主教就是耶穌教，從此即有“彈劾”湯若望的念頭。

順治十六年至十七年之間，楊光先撰寫了《辟邪論》上、中，下三篇以及《摘謬十論》、《正國(guó)體呈》、《中星說(shuō)》、《選擇議》等多篇文章，又多次親自來(lái)到禮部，通政使司等衙門狀告湯若望。楊光先指出，天由二氣結(jié)撰而成，并非天主所造。耶穌是彼國(guó)謀叛的罪魁，因事敗露而被正法，絕非造天圣人。所謂天主耶穌于漢元壽二年降生之說(shuō)，純屬荒唐怪誕?！叭粢d即是天主，則漢哀以前盡是無(wú)主之世界”。“設(shè)天果有天主，則覆載之內(nèi)四海萬(wàn)國(guó)，無(wú)一而非天主之所宰制，必?zé)o獨(dú)主如德亞一國(guó)之理。獨(dú)主一國(guó)，豈得稱天主哉”。他進(jìn)而又說(shuō)，湯若望等“非我族類，其心必殊”，倘若天下之人，“只愛其器具之精工，而忽其私越之干禁”，則無(wú)異于“愛虎豹之文皮，而豢之臥榻之內(nèi)，忘其能噬人矣”。

同時(shí)，又斥責(zé)湯若望在《時(shí)憲歷書》封面上題寫“依西洋新法”五個(gè)字，其目的是“借大清之歷以張大其西洋，而使天下萬(wàn)國(guó)曉然知大清奉西洋之正朔”。說(shuō)湯若望借西洋新法陰行邪教，而“謀奪人國(guó)是其天性，今呼朋引類，外集廣澳，內(nèi)官帝掖，不可無(wú)蜂蠆之防”。因?yàn)楫?dāng)時(shí)順治帝尚在，湯若望仍受朝廷器重，而禮部又不理睬楊光先的狀告，所以湯若望等人對(duì)楊光先的反教舉動(dòng)未加重視。

康熙年間

康熙初，湯若望等耶穌會(huì)士加緊宣傳天主教，將天主教捧為全世界之惟一正教，只以天主教為獨(dú)尊。湯若望與當(dāng)時(shí)在京的傳教士利類思、安文思、南懷仁(Ferdinand Verbiest，1623—1688，比利時(shí)人)等人認(rèn)真研究之后，令奉教欽天監(jiān)夏官正李祖白執(zhí)筆，根據(jù)明崇禎皇帝所賜“欽褒天學(xué)”匾額的“天學(xué)”二字，于康熙二年(1663年)冬撰寫了《天學(xué)傳概》一書，三年正月，又求國(guó)子監(jiān)助教許之漸為該書作序。該書刊行之后，散發(fā)給在華天主堂的傳教士及有關(guān)人員。據(jù)湯若望、李祖白等人講，此書是針對(duì)楊光先指責(zé)天主教為邪教的論點(diǎn)而作，以闡明天主教并非邪教，而是正教。但是，在該書中卻大談特談許多令當(dāng)時(shí)人無(wú)法理解和接受的觀點(diǎn)。譬如，在該書中寫到，“天主上帝開辟乾坤，生初人男女各一。初人子孫聚居如德亞國(guó)”。其后生齒日繁，散走世界各地?！翱贾穬?cè)，推之歷年，在中國(guó)為伏羲氏，即非伏羲，亦必先伏羲不遠(yuǎn)為中國(guó)有人之始。此中國(guó)之初人，實(shí)如德亞之苗裔”。接著又說(shuō)到，中國(guó)自有初人之始，即信奉天主之教，而六經(jīng)四書之類，不過(guò)是天主教的“微言法語(yǔ)”。

自秦始皇焚書之后，天主教也在中國(guó)失傳。等等。這種將中國(guó)的社會(huì)，宗教思想甚至人種完全納入歐洲的體系，變成為歐洲的附庸和分支的理論，充分反映了歐洲中心，歐洲至上論的傲慢與偏見，導(dǎo)致了人們的極大反感和不信任。

楊光先見到《天學(xué)傳概》一書后，把它當(dāng)作擊敗湯若望的一把利劍，于1664(康熙三年)三月二十五日，先寫信給該書的作序者許之漸，指斥天主教是邪教，《天學(xué)傳概》是妖書，敦促許之漸舉揭湯若望，反對(duì)天主教。于七月二十六日，又寫《請(qǐng)誅邪教狀》一文，再赴禮部呈遞，正式控告湯若望有三大罪狀：一是潛謀造反，二是邪說(shuō)惑眾，三是歷法荒謬。又將《天學(xué)傳概》一本、《邪教圖說(shuō)》三本、《正國(guó)體呈》稿一本、《與許之漸書》稿一本，以及金牌，繡袋，會(huì)期等物，一并遞呈禮部，要求依律將湯若望正法。

清廷從三年八月初六日至四年七月，用將近一年的時(shí)間審理此案，最后作出了禁止耶穌會(huì)士在中國(guó)傳播天主教的決定。并拘審捕外省傳教士30余人解京。判湯若望絞刑。由于當(dāng)時(shí)北京接連五天發(fā)生地震，加之“太皇太后(順治母后)力主開釋”，湯若望才免于一死。清廷又恐傳教士們?nèi)匀粋鹘蹋胀?，建堂，也?yán)加飭交繼任各官防范。這就是康熙初年發(fā)生的有名的“教案”。

1666年(康熙五年)8月15日，湯若望逝于南堂，享年75歲。1669(康熙八年)9月，湯若望得到徹底昭雪，恢復(fù)“通玄教師”之名，1669年12月8日，康熙帝賜地重葬湯若望于利瑪竇墓旁，御賜祭文一篇，鐫刻在湯若望墓碑的反面，從“鞠躬盡瘁，恤死報(bào)勤，國(guó)之盛典”等用詞足以見中國(guó)一代明君對(duì)這位來(lái)自萬(wàn)里之遙、萊茵河畔的德國(guó)傳教士高度的評(píng)價(jià)和認(rèn)同。

這場(chǎng)以“歷法之爭(zhēng)”為名、實(shí)則為兩種不同文化較量的歷案，以當(dāng)時(shí)湯若望們的失敗與犧牲而結(jié)束，但楊光先們所表現(xiàn)出的盲目排外，也使中國(guó)在后來(lái)付出了沉重的代價(jià)。

湯若望怎么死的？

湯若望是病死的。

順治元年(1644)，清軍進(jìn)入北京，明亡。湯若望以其天文歷法方面的學(xué)識(shí)和技能受到清廷的保護(hù)，受命繼續(xù)修正歷法。他用西法修訂的歷書被清廷定名《時(shí)憲歷》，頒行天下。同年十一月，命掌欽天監(jiān)事。

次年，他以《崇禎歷書》為基礎(chǔ)纂成《西洋新法歷書》一百零三卷，進(jìn)呈攝政王多爾袞，封太常寺少卿。八年順治帝親政后，先后授太仆寺卿、太常寺卿、通政使并賜號(hào)“通玄教師”(康熙帝時(shí)為避諱，改“通微教師”)。湯若望經(jīng)常出入宮廷，對(duì)朝政得失多所建言，先后上奏章三百余封。順治帝臨終議立嗣皇，曾征求湯若望意見?？滴跞?1664)，楊光先在輔政大臣鰲拜等支持下，控告湯若望等傳教士借修歷為名，內(nèi)外勾連，謀為不軌。湯若望被捕入獄，次年擬凌遲處死。不久京師地震，湯若望免死羈獄，旋獲孝莊太皇太后特旨釋放。

康熙五年七月十五(1666年8月15日)，病死于寓所。