到三十一年(1603)十一月甲子日凌晨，從朝房到各個(gè)勛戚大臣的門(mén)口，都有一封匿名信，名叫《續(xù)憂危..議》，說(shuō)貴妃與大學(xué)士朱賡、兵部尚書(shū)王世揚(yáng)、三邊總督李汶、保定巡撫孫瑋、少卿張養(yǎng)志、錦衣衛(wèi)都督王之楨、千戶(hù)王名世、王承恩等人相勾結(jié)，圖謀更換太子，語(yǔ)言更加荒誕不經(jīng)。

陳矩把這封信交給皇上，大學(xué)士朱賡也進(jìn)去了?；噬洗笈?，敕令陳矩和錦衣衛(wèi)大加搜索，一定要查出制造妖書(shū)的人。當(dāng)時(shí)大案突然發(fā)生，偵緝官校在都城四處活動(dòng)，捕風(fēng)捉影，濫加拘捕，因此被牽連的人很多。王之楨想陷害錦衣衛(wèi)指揮周嘉慶，首輔沈一貫想陷害次輔沈鯉、侍郎郭正域，他們都派人囑咐陳矩。陳矩嚴(yán)正拒絕了他們。

不久百戶(hù)蔣臣將..生光捉來(lái)。..生光是京師無(wú)賴(lài)之徒，曾偽造富商包繼志的詩(shī)，其中有“鄭主乘黃屋”一句，以此來(lái)威脅國(guó)泰和包繼志，索取黃金，所以人們懷疑而將他逮捕。

對(duì)他嚴(yán)刑審問(wèn)他都不承認(rèn)，妻妾子弟都被拷打得體無(wú)完膚。陳矩心想..生光即便是冤枉，但先前的罪名已夠判他死罪，而且此案如果沒(méi)有主犯，皇上必定非常憤怒，恐怕將輾轉(zhuǎn)牽連不已。禮部侍郎李廷機(jī)也認(rèn)為..生光前面的詩(shī)句與妖書(shū)詞語(yǔ)相合。于是定案，..生光被凌遲處死。沈鯉、郭正域、周嘉慶以及其他受牽連的人，都賴(lài)陳矩得以保全。

在萬(wàn)歷年間，皇帝讓陳矩去辦一件事情。讓他懲治一位因犯罪而被停職的將軍，處理完這件事之后，他在回來(lái)的路上正好經(jīng)過(guò)自己的故鄉(xiāng)，就想要去祭祀一下祖先。

百姓很是害怕宦官回鄉(xiāng)的，因?yàn)樗麄冊(cè)谶@途中總是會(huì)借機(jī)收取百姓一些錢(qián)，裝進(jìn)他們自己的口袋。這不在陳矩回鄉(xiāng)時(shí)，安肅縣的百姓就害怕陳矩也是這樣。沒(méi)想到呀，陳矩回來(lái)后就是簡(jiǎn)單上了個(gè)墳，就離開(kāi)了，并沒(méi)有向百姓索要一分錢(qián)。像他這樣的太監(jiān)太少了，他就是百姓心中的神。

后來(lái)的陳矩憑借自己的努力，當(dāng)上了東廠的掌門(mén)人，到達(dá)了權(quán)力的巔峰。他在掌管東廠時(shí)，朝廷風(fēng)氣也一直很好，大臣們很是欽佩他。