16世紀(jì)后期至17世紀(jì)初，錫伯族被滿洲統(tǒng)治者征服，編入了八旗蒙古和八旗滿洲。在100多年中，錫伯族人民從自己長期聚居的地區(qū)分散到許多地區(qū)，被迫進(jìn)行了四次大遷徙：第一次是康熙三十一年（1692年），脫離了科爾沁蒙古，被編入滿洲八旗；第二次是康熙三十八年至四十一年（1669年—1702年），錫伯族部分入盛京（今沈陽）；第三次是乾隆二十九年（1764年），有1016人被征調(diào)到新疆戍邊，攜同隨軍家屬2千多人。從此，錫伯族分居?xùn)|北、西北兩地。青年人充當(dāng)“披甲”，服役當(dāng)差，閑散附丁和家屬則從事農(nóng)副業(yè)生產(chǎn)。第四次是乾隆三十四年（1779年），派1000名錫伯士兵駐守云南要塞。八旗制度使錫伯族處于清朝的直接統(tǒng)治之下，經(jīng)濟(jì)生活和社會(huì)組織都發(fā)生了急劇變化，由原來流動(dòng)性較大的漁獵經(jīng)濟(jì)轉(zhuǎn)向穩(wěn)定的農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)。

錫伯族勤勞勇敢，為開發(fā)和保衛(wèi)祖國的邊疆作出了貢獻(xiàn)。移居新疆的錫伯族人民對(duì)于伊犁、塔城和博爾塔拉地區(qū)的農(nóng)田水利發(fā)展起了很大作用。乾隆三十二年（1767），新疆錫伯族被編為八個(gè)牛錄（旗），于伊犁河流域屯田駐守。嘉慶七年（1802），在錫伯營總管圖爾根支持下，經(jīng)過艱苦奮戰(zhàn)，從察布查爾山口引水，自崖上開鑿大渠，終于引來伊犁河水灌溉良田，故取名為“察布查爾渠”，意為“糧倉”。錫伯族人民先后定居在大渠南北。其后，又與八旗兵一起，先后在伊犁、博爾塔拉、塔城等地開鑿一些水渠，開墾了10余萬畝良田，并使當(dāng)?shù)匾恍┬值苊褡鍖W(xué)到許多農(nóng)業(yè)生產(chǎn)知識(shí)和技術(shù)。

19世紀(jì)20年代，英殖民主義走狗張格爾披著宗教外衣，在南疆煽動(dòng)叛亂。錫伯營官兵800余人應(yīng)征隨同清軍出師討伐，在追殲殘敵的喀爾鐵蓋山戰(zhàn)斗中，生擒張格爾。接著，他們?cè)诜纯挂晾绲貐^(qū)“蘇丹汗國”，抗擊沙皇對(duì)伊犁的殖民統(tǒng)治的斗爭中，英勇不屈。1876年，當(dāng)清軍收復(fù)新疆時(shí)，他們?cè)诳偣芸柮У膸ьI(lǐng)下，積極配合，為收復(fù)南疆和伊犁作出了貢獻(xiàn)。

1911年辛亥革命爆發(fā)后，居住于新疆的錫伯族人民和當(dāng)?shù)匦值苊褡逡黄鸱e極響應(yīng)，但斗爭果實(shí)被封建軍閥楊增新、金樹仁、盛世才所篡奪，錫伯族人民又處于他們的統(tǒng)治之下。1944年，國民黨繼續(xù)了盛世才的殘酷統(tǒng)治。同年9月，伊犁、塔城、阿勒泰三區(qū)革命爆發(fā)，察布查爾錫伯族組成錫伯獨(dú)立騎兵連，塔城、霍城的錫伯族建立武裝隊(duì)伍，與其他兄弟民族一起參加這一革命，進(jìn)行了反對(duì)國民黨統(tǒng)治的斗爭。

1931年“九·一八”事變后，居住在東北地區(qū)的錫伯族和漢、滿等族人民一起投入抗日斗爭。遼寧省沈陽大五家子一帶的錫伯族積極參加了抗日聯(lián)軍，多次狙擊遼河平原的敵人。在這一時(shí)期有不少錫伯族青年參加中國共產(chǎn)黨。在中國共產(chǎn)黨的領(lǐng)導(dǎo)下，隨著解放戰(zhàn)爭的節(jié)節(jié)勝利，東北和新疆的錫伯族人民先后在1946年和1949年獲得解放。

中華人民共和國成立后，錫伯族進(jìn)入民族平等、團(tuán)結(jié)互助的新時(shí)代，政治上享有了和各族平等的權(quán)利。1954年實(shí)現(xiàn)了民族區(qū)域自治，在新疆原寧西縣成立了察布查爾錫伯自治縣，進(jìn)行了一系列社會(huì)改革，走上了社會(huì)主義道路。